La automatización es un sistema que consiste en sustituir las cajoneras o estanterías por un robot, reduciendo considerablemente el espacio necesario de almacenaje.Los medicamentos se introducen dentro del robot y éste, mediante su brazo mecánico, los va colocando en sus baldas de tal manera que se optimiza el espacio de su interior al máximo.
Cuando sea necesario dispensar un medicamento, el personal de la farmacia lo único que tiene que hacer es solicitar el medicamento a través del programa informático de la farmacia y el robot, automáticamente lo coge y lo lleva mediante diferentes sistemas de transporte (espirales, cintas de transporte, rampas, salidas directas, etc.) al punto de venta donde se encuentre la persona.
De este modo el personal no se tiene que desplazar al interior de la farmacia dejando solo al cliente y pudiendo ofrecer una atención farmacéutica de mayor calidad.